鄂尔多斯市工商联成立于1985年，成立时称“内蒙古工商联伊盟办事处”，1993年更名为伊盟工商联，1996年经批准，加挂“伊盟民间商会”的牌子。2001年撤盟设市时，伊盟工商联（民间商会）正式更名为鄂尔多斯市工商业联合会（总商会），一个机构两个牌子。 

　　鄂尔多斯市工商业联合会（总商会），按照《中华全国工商业联合会章程》开展工作，主要职能和任务是：加强各改进非公有制经济人士思想政治工作；参加政治协商，发挥民主监督作用，积极参政议政；协助政府管理和服务非公有制经济；促进行业商（协）会改革发展；参与协调劳动关系，协同社会治理，促进社会和谐稳定；引导非公有制企业和非公有制经济人士依法诚信经营，了解反映非公有制企业和非公有制经济人士利益诉求，维护其合法权益，参与经济纠纷调解、仲裁；依法加强会产管理，经营和保护；承办市委、市政府交办的其他事项和自治区工商联及市有关部门的委托事项。 

　　目前，鄂尔多斯市工商业联合会（总商会）下设办公室、会员部、经济部、非公党建办4个内设部室，鄂尔多斯市非公有制经济服务中心1个二级事业单位，共有干部15名。2022年4月，鄂尔多斯市工商业联合会（总商会）召开第五次代表大会，选举产生了新一届执行委员会，执委会组成人员335名，其中主席（会长）1名，常务副主席1名，专职副主席（副会长）2名，兼职副主席26名，兼职副会长21名，秘书长1名，常委59名，执委224名。